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对于多重实验,Primer Premier允许您以批量模式启动引物搜索,然后检查所设计引物的交叉反应性,从而减少假引物。
Primer Premier PCR引物设计软件 自动同源性和避免模板结构 Primer Premier自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有显著交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特,避免模板结构提高设计引物的效率。 手动引物搜索 Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的位置来设计感测或反义引物。
通过将它们*为标准GenBank/dbSNP文件中的变异特征,还可以加载数百个未发布的snp。在*snp后,引物可以被设计用来放大它们,使用探针化学方法进行检测。
然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。 Edit Template Sequence The template sequence can be edited. Bases can be modified using the standard Cut/Copy/Paste functions, to zero-in on the location of interest. Unwanted regions of sequences can be removed by selecting them and clicking Delete. The program also allows a user to add comments or annotations for the sequence for future reference.
Primer Premier PCR引物设计软件 编辑模板序列 模板序列是可编辑的,可以由用户来更改。可以使用标准的剪切复制粘贴来进行修改。通过使用Delete按钮可以不需要的序列区域。
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