PRIMERPLEX软件培训班

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To assure primer specificity, primers can be BLAST searched from PrimerPlex against any of the genomic databases available at NCBI. Multiplex SNP Detection and High Throughput Genotyping Multiplex PCR Primer Design Comprehensive Assay Support Next Generation Sequencing Assay Primer Specificity Evaluate Pre-Designed Primers and Probes Addition of MagPlex TAGs

在为每个序列了oligo之后，对它们的属性进行分析，并为发现的偏差提醒用户。对于预先设计的oligos不可用的序列，PrimerPlex设计它们，检查它们是否复用，并强调兼容性问题。然后用户可以决定接受这个设计或者创建一个单的池。这个功能在用户的手中提供了完全的控制。 添加MagPlex TAGs 该程序现在还支持一个MagPlex TAGs的数据库，以及MicroPlex xTAGs（以前称为FlexMAP TAGs），用于自动向每个ASPE引物添加适当的标签。标签是这样选择的，它们使二聚化小化，并且不折叠在它们所附着的oligo上。此外，用户可以覆盖程序的建议，并自己选择标签。

PrimerPlex使您能够通过它们中每一个设计oligo，来检测一个中等大小的基因组序列的所有突变。检查这些引物和探针以进行复用，并显示佳可能的。
多重PCR引物设计 设计用于多重分析的引物集可能是一项具有挑战性的任务。PrimerPlex使用创新的和专有的算法来设计优的多重引物集，大限度地减少Tm失配所有的进行交叉反应分析，以确保特定和有效的扩增。您可以从一系列交替呈现的排序顺序中选择适合您的实验需求的。使用PrimerPlex，您可以灵活地设计引物，无论是朝向3'端，还是5'端，在这些端点的距离或序列内的地方。

如果标签不是的，或者选择的标签与oligo不兼容，PrimerPlex会向用户发出警报。 Next Generation Sequencing Assay With PrimePlex, designing multiplex oligos for pre-sequencing sample preparation and mutation detection such as SNPs, DIPs (Deletion/Insertion Polymorphisms) and MNPs (Multiple Nucleotide Polymorphisms) is as easy as clicking a few buttons. Primer Specificity The program BLAST searches multiple sequences in a single search run. The results are automatically interpreted and the homologies identified are avoided during primer design, ensuring that the design is highly specific.
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