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北京天演融智软件有限公司(科学软件网)前身是北京世纪天演科技有限公司,成立于2001年,专注为国内高校、科研院所和以研发为主的企事业单位提供科研软件和服务的。科学软件网提供的软件覆盖各个学科,软件数量达1000余款,满足各高校和企事业单位的科研需求。此外,科学软件网还提供软件培训和研讨会服务,目前视频课程达68门,涵盖34款软件。
Primer Premier是设计和分析PCR引物的全面的软件。Primer Premier通过利用接近的热力学算法和的熔化温度,找到优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很容易地操作序列并分析您的引物设计的结果。
Primer Premier PCR引物设计软件 自动同源性和避免模板结构 Primer Premier自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有显著交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特,避免模板结构提高设计引物的效率。 手动引物搜索 Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的位置来设计感测或反义引物。
通过将它们*为标准GenBank/dbSNP文件中的变异特征,还可以加载数百个未发布的snp。在*snp后,引物可以被设计用来放大它们,使用探针化学方法进行检测。
The program also evaluates the properties of pre-designed primers and ranks them for you to adjudge how far the primers are from their desired target values. This feature is especially useful if you are working with published or pre-designed well proven primers. For any given primer, it even designs a compatible forward or reverse primer.
Edits Template sequences to add new bases or delete unwanted regions. Exports a publication quality report for the assays designed for sharing with colleagues. Includes a built-in calculator for computing the GC%, the base count and to obtain the complement and the reverse complement.
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