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Primer Premier通过利用接近的热力学算法和的熔化温度,找到优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很容易地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让Primer Premier为您挑选好的引物。 Local & Desktop BLAST Options You can BLAST your sequences against local custom databases using the Local and Desktop BLAST options. Create a database of sequences in text or FASTA format on your computer and BLAST your query sequence from Primer Premier.
用户可以评论或注释一个序列并保存它们以备将来参考。 功能特征 新改进的搜索算法 自动顺序检索 自动同源和模板结构避免 评估预先设计引物 手动引物搜索 编辑模板序列 序列浏览 生成报告 本地/桌面搜索功能选项 计算器 数据/数据库管理 Primer Design for SNP Genotyping Assays With Primer Premier, you can load sequences from dbSNP and have the primers designed flanking the SNP selected. Hundreds of unpublished SNPs can also be loaded by specifying them as variation features in standard GenBank/dbSNP files. After specifying the SNPs, primers can be designed to amplify them for detection using a probe-based chemistry. Read More >>
Retrieves batches of sequences directly into the program from GenBank and dbSNP using accession /GI numbers and assay IDs. Performs BLAST and template structure search and avoids cross homologies and secondary structures while designing primers. Supports Local and Desktop BLAST options for using local custom/unpublished databases.
引物特异性可以通过执行BLAST搜索和从程序内部搜索模板结构来实现。这两种搜索结果都用于设计引物。
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