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自动序列检索快速检索批量序列直接从GenBank和dbSNP程序使用登录/GI号和检测id。使用多重检索功能,序列可以从本地驱动器加载。
使用PrimerPlex,您可以灵活地设计引物,无论是朝向3'端,还是5'端,在这些端点的距离或序列内的地方。 对于SNP的基因型分析,该程序设计了引物旁侧突变,如SNPs、DIPs(/插入多态性)和MNPs(多核苷酸多态性)。 全面的分析支持 使用PrimerPlex为多重PCR、ASPE和直接杂交分析设计oligos。oligos被筛选为交叉反应性,以确保高信号强度,大限度地减少Tm失配。oligos筛选二聚体、运行和重复。 下一代测序分析 使用PrimePlex设计多重oligos,用于预先测序的样品制备和突变检测,如SNPs,DIPs(/插入多态性)和MNPs(多核苷酸多态性),就像点击几个按钮一样简单。 引物特 程序BLAST搜索在单个搜索运行中搜索多个序列。
生成报告您可以为您为实验室笔记本设计的分析创建演示质量报告,并与同事共享信息。
添加MagPlex TAGs 该程序现在还支持一个MagPlex TAGs的数据库,以及MicroPlex xTAGs(以前称为FlexMAP TAGs),用于自动向每个ASPE引物添加适当的标签。标签是这样选择的,它们使二聚化小化,并且不折叠在它们所附着的oligo上。此外,用户可以覆盖程序的建议,并自己选择标签。如果标签不是的,或者选择的标签与oligo不兼容,PrimerPlex会向用户发出警报。 对于SNP的基因型研究,PrimerPlex设计了SNP的旁侧引物。其结果包括每个DNA模板的引物对,包括产品尺寸、退火温度等物理化学寡聚物性能。此外,二级结构的图形显示也可用以帮助确定它们是否会阻碍反应。
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