PRIMER PREMIER怎么用

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新的改进的搜索算法新的改进的搜索算法。自动同调和模板结构回避。序列视图显示序列上的引物。新的改进的图形用户界面。

引物的延伸可能会由于在延伸温度下模板结构的存在而受阻。为了避免所有这样的区域，模板可能折叠在自己上，程序利用一个专有的算法来检查在模板中的可能的二级结构

手动引物搜索 Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项，用户可以选择模板序列上的位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户终选择的引物。 Primer Premier软件还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择，有纤毛虫大核（Ciliate Macronuclear）、无脊椎动物线粒体（Invertebrate Mitochondrion）、支原体（Mycoplasma）、植物线粒体（Plant Mitochondrion）、原生动物线粒体（Protozoan Mitochondrion）、一般标准（Standard）、脊椎动物线粒体（Vertebrate Mito-chondrion）和酵母线粒体（Yeast Mitochondrion）。

这些同源区域在序列视图中被**显示，并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构，可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠，在您的折叠温度下，程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中，二级结构形成的区域下面用横线强调，并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特，避免模板结构提高设计引物的效率。
Primer Premier PCR引物设计软件 标准PCR分析的引物设计 Primer Premier是设计和分析PCR引物的全面的软件。
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